１４７１年，葡萄牙商人将中国甜橙（有资料显示为“雪柑”甜橙）引种到葡萄牙里斯本地区种植。１５４９年，葡萄牙侨民将里斯本地区种植的中国甜橙带入巴西，种植在Ｂａｈｉａ市的Ｓｅｌｅｃｔ地区。１８１０年，在Ｓｅｌｅｃｔ地区种植的有籽甜橙发生芽变，产生了无籽甜橙，被称为Ｓｅｌｅｃｔ甜橙。１８２４年，澳大利亚从巴西引种Ｓｅｌｅｃｔ甜橙。美国于１８３５年和１８３８年两次引种Ｓｅｌｅｃｔ甜橙种植在佛罗里达州，但均引种失败。
１８７０年，美国再次引种Ｓｅｌｅｃｔ甜橙种植在华盛顿地区的美国农业部温室中，此次引种成功；１８７３年，引种定植在加利福尼亚州的佛塞德地区，１８７８年栽培植株表现良好，因１８７０年引种标记遗失，故命名为华盛顿脐橙。此后，华盛顿脐橙开始全球之旅，形成了大量的新品系后代，各国育种学家从庞大的脐橙家族中选育出超过１９０个新品种，如：罗伯逊脐橙、巴哈宁哈脐橙、维纳林娜脐橙、帕尔默脐橙、纽荷尔脐橙、晚棱脐橙、龙回红脐橙、青秋脐橙、褐色脐橙等。
据资料显示，基本上一系列脐橙品种直接或间接来源于华盛顿脐橙芽变。已知来源的１７４个脐橙品系（种）分别来源于２５个母本。其中，１０１个品系（种）直接为华盛顿脐橙芽变，占比５８．３８％，又有７２个品种来源于２３个华盛顿脐橙芽变后代。中国４６个脐橙品系（种）起源于１４个母本，石棉脐橙起源于四川省石棉县种植的地方甜橙。从华盛顿脐橙为母本选育了以奉节脐橙为代表的８个品种，重庆选育了３个品种，四川省和湖南省各选育２个品种。云南报道保山市蒲缥公社一年三次开花三次成熟的脐橙，并在果园高接换种，也表现出同样性状，起名为蒲缥三季脐橙，但未进行不同脐橙种植区域多点试验观察验证其遗传稳定性。奉园７２－１在重庆奉节地区是主栽品种，随后又从奉园７２－１中选育了３个晚熟品种。纽荷尔脐橙占到中国脐橙栽培面积的８０％以上，以赣南地区为主栽区域。
８个不同省份从纽荷尔脐橙中选育了１７个品种，江西省选育了４个品种，龙回红脐橙较为代表，湖北省选育了华红脐橙（也称长虹脐橙），湖南省选育了３个品种，贵州省选育了４个品种。四川省选育了眉红脐橙，重庆又从眉红脐橙芽变中选育了青秋脐橙。从选育品种资料看，１７个纽荷尔脐橙后代品种均与纽荷尔脐橙母本为参照对象，目前还没有将这１７个品种进行生物学和分子基因等方面的系统鉴定与评价，寻找出１７个品种间的差异性。以罗伯逊脐橙为母本选育了８个品种，四川省选育了以金堂脐橙为代表的６个品种，浙江省选育了９５４脐橙，湖北省以罗伯逊脐橙和龟井温州蜜柑嫁接嵌合体选育的早红脐橙，果实外观像脐橙，果皮类似脐橙果皮，果肉类似温州蜜柑，果肉色泽为橙红色。
美国４５个脐橙品系（种）起源于８个母本，其中３３个品种来自华盛顿脐橙，以纽荷尔脐橙、罗伯逊脐橙为代表。南非１２个脐橙品系（种）起源于４个品种４。南非以ＳＵＮ（Ｅｘｐ．）为代表１３个品种在区试中，未注明母本。其代表品种为帕尔默（无籽）脐橙、金巴利（威尔士）。澳大利亚１８个品系（种）起源于４个品种，以威尔逊脐橙为代表的４个品种未注明母本。其代表品种为棱脐橙和晚棱脐橙。澳大利亚ＰａｃｉｆｉｃＦｒｅｓｈ公司于２００９年在其位于Ｌｅｅｔｏｎ的柑桔种植园中发现果皮褐色的脐橙，通过数年的测试、培育与种植，将褐色脐橙命名为Ｄｏｌｓｉ脐橙进行商业化的种植与销售。
湖北省秭归地区从晚棱脐橙选育了棕色脐橙，命名为棕橙。这２个新选育的新品种脐橙均来自晚棱脐橙，有待进一步利用现代生物技术进行鉴别。西班牙７个脐橙品系（种）起源于３个品种，以维纳林娜脐橙为代表。巴西８个脐橙品系（种）起源于３个品种，以巴哈宁哈脐橙为代表。日本选育的３２个品种以早中熟为主，均来自华盛顿脐橙，以清家脐橙、福本脐橙为代表。委内瑞拉从华盛顿脐橙的芽变中选育ＣａｒａＣａｒａ脐橙。卡拉卡拉脐橙果肉粉红色至红色，是目前已知唯一商业化种植果肉富含番茄红素的柑桔品种。
卡拉卡拉脐橙通过“９４８”项目引入我国示范推广，２００２年通过福建省农作物品种审定委员会认定。卡拉卡拉脐橙在栽培过程中，枝条木质部和维管束出现粉红色（红枝），红枝和白枝不影响果肉颜色。红枝条型卡拉脐橙树势中庸偏弱，着果率较高，果实偏小，汁多，产量不稳。白枝条型卡拉脐橙树势中庸强，着果率较低，果实大，采取保花保果技术容易高产。