土壤管理是实现脐橙优质高产低耗的重要手段之一，土壤条件的优劣直接影响根系的生长发育。通过土壤管理可以控制杂草生长，保持土壤生产力，防止水土流失，改良土壤理化特性，促进有益微生物活动，为脐橙的生长发育创造良好的地下环境。
1.土壤改良
土壤是脐橙树体生长发育所需营养物质和水分的来源。我国脐橙产区大部分处在丘陵山地，土壤有机质含量、疏松程度、深厚等与美国等生产脐橙的主产国相比差距甚大，所以改良土壤，提高土壤肥力是无公害脐橙栽培管理的重点之一。
新建的果园，在定植前已挖好定植穴，并施入肥料，可以满足幼树生长的需要。但脐橙根系深广，主要分布在土层以下0.6~0.8米，深的可达1米左右，而且，随着树冠的扩大，根系向四周扩展逐渐超出定植穴的范围，如不及时改良土壤，就会抑制根系的生长，影响脐橙的生长发育。因此，除少数具有深厚土层的脐橙园外，多数脐橙园均需土壤改良。土壤改良一般采用壕沟式改土、扩穴改土和培土三种方法。
（1）土壤改良的时间
脐橙园土壤改良的时间应根据当地的气候条件和根系活动的时间而定，通常壕沟式改土和扩穴改土以夏、秋两季根系生长高峰前的5~6月和9~10月进行为宜，此时改土，气候适宜，土壤湿润，改土时根部的伤口容易愈合，对树体伤害较轻。冬季低温少雨的脐橙产区，也可在2~3月改土。培土则在夏季干旱和冬季低温前进行。
（2）土壤改良的方法
①壕沟式改土：平地脐橙园一般在行间挖宽0.8~1米、深0.6~0.8米的沟，分两层填入肥料。底层施入绿肥堆肥30千克/米3、石灰1千克/米，上层施腐熟人畜粪20千克/米3、复合肥1千克/米3。绿肥、杂草、秸秆及挖出来的心土放在下层，人畜粪、复合肥和表土放在上层。注意两层材料与土壤要充分混合，以免肥料浓度过高而使根系脱水。覆土要高出地面10~15厘米，以免绿肥、杂草、秸秆腐烂后导致土面下沉而积水。山地脐橙园只在梯田内侧和株间挖沟，外侧不挖，以免梯壁垮塌。挖沟位置每年要轮换，2~3年可全园深翻1次。
②扩穴改土：扩穴改土一般在定植后第二年进行，每年沿定植穴边扩穴改土1~2次。在紧靠原定植穴外围相对的两侧挖宽40~50厘米、深40厘米的空穴。穴内填肥量同上述壕沟式改土。扩穴改土要从定植穴两侧开始，下年度再改土另两侧，并逐步向外扩展。扩穴改土最好在幼树期三年内完成，因为幼树树冠小，株行间空间大，作业方便，根系损害小，而成年树根系已布满全园，扩穴改土会大量伤根，对树势、产量影响较大。
③培土：培土又称客土，常用于改良红黄壤和河滩地脐橙园土壤，还可用于干旱季节的抗旱和寒冬季节的抗寒。红黄壤脐橙园，土壤黏瘠，可培以沙性土；河滩地脐橙园土壤多沙，可培以黏性土，来改善土壤结构。此外，培土还可增加土层厚度，减少水分蒸发，夏季降低土温，冬季增加土温，在瘠薄果树园效果明显，对防止脐橙树早害、冻害有一定的效果。海涂脐橙园培土，还可改良土质，以淡冲咸，以淡压盐，起到防止盐害的作用。
除了改良红黄壤和河滩地脐橙园土壤采用相应的客土外，一般抗旱和抗寒时的培土，常用肥沃的土壤、河泥、塘泥、菜园土等培土。培土时间宜在冬季，培土前先中耕松土，然后再培土。培土的高度以高出地面10厘米为宜，不能培得太高，否则会影响树体根部的正常呼吸，限制土壤中微生物的活动，使树根基部长出与原根系争夺营养的新根，而新根到夏秋季干旱时，又会因土墩缺水而枯死，造成大量营养的损失。培土太少，也会严重地限制根部的正常生长发育，进而影响树干、枝、叶的生长。注意：培土后不能再压紧，以免松土沉后积水。大面积客土困难，可分期分批培土，一般每隔1~2年培土1次。